SummaryRMgm-4577
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Successful modification | The parasite was generated by the genetic modification |
The mutant contains the following genetic modification(s) | Gene mutation, Gene tagging, Introduction of a transgene, Introduction of a transgene |
Reference (PubMed-PMID number) |
Reference 1 (PMID number) : 30597708 |
MR4 number | |
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Parent parasite used to introduce the genetic modification | |
Rodent Malaria Parasite | P. berghei |
Parent strain/line | P. berghei ANKA |
Name parent line/clone | P. berghei ANKA cl15cy1 |
Other information parent line | A reference wild type clone from the ANKA strain of P. berghei (PubMed: PMID: 17406255). |
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The mutant parasite was generated by | |
Name PI/Researcher | Obrova K, Mair GR, Mueller AK |
Name Group/Department | Center for Infectious Diseases, Parasitology Unit |
Name Institute | Heidelberg University Hospital |
City | Heidelberg |
Country | Germany |
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Name of the mutant parasite | |
RMgm number | RMgm-4577 |
Principal name | Δflp::HA gam (820) |
Alternative name | |
Standardized name | |
Is the mutant parasite cloned after genetic modification | Yes |
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Phenotype | |
Asexual blood stage | Not different from wild type |
Gametocyte/Gamete | FLP::HA was clearly depleted in gametocytes. Normal gametocyte production |
Fertilization and ookinete | No ookinete formation (large numbers of unfertilised gametocytes). Mature male and female gametocytes/gametes failed to egress from their host red blood cell, thereby preventing fertilisation |
Oocyst | No oocyst formation |
Sporozoite | No oocyst (or sporozoite) formation |
Liver stage | Not tested |
Additional remarks phenotype | Mutant/mutation From the paper: |
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Details of the target gene | |||||||||||||||||||||||||||
Gene Model of Rodent Parasite | PBANKA_1224400 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Model P. falciparum ortholog | PF3D7_0806300 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene product | ferlin, putative | ||||||||||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | ferlin-like protein, FLP | ||||||||||||||||||||||||||
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Details of the genetic modification | |||||||||||||||||||||||||||
Short description of the mutation | 'Promoter swap' mutant: the promoter of FLP replaced by the promoter of clag (PBANKA_1400600) | ||||||||||||||||||||||||||
Inducable system used | No | ||||||||||||||||||||||||||
Short description of the conditional mutagenesis | Not available | ||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks inducable system | |||||||||||||||||||||||||||
Type of plasmid/construct | (Linear) plasmid double cross-over | ||||||||||||||||||||||||||
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No | ||||||||||||||||||||||||||
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No | ||||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct map | |||||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct sequence | |||||||||||||||||||||||||||
Restriction sites to linearize plasmid | |||||||||||||||||||||||||||
Selectable marker used to select the mutant parasite | tgdhfr | ||||||||||||||||||||||||||
Promoter of the selectable marker | eef1a | ||||||||||||||||||||||||||
Selection (positive) procedure | pyrimethamine | ||||||||||||||||||||||||||
Selection (negative) procedure | No | ||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks genetic modification | |||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks selection procedure | |||||||||||||||||||||||||||
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Details of the target gene | |||||||||||||||||||||||||||
Gene Model of Rodent Parasite | PBANKA_1224400 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Model P. falciparum ortholog | PF3D7_0806300 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene product | ferlin, putative | ||||||||||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | ferlin-like protein, FLP | ||||||||||||||||||||||||||
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Details of the genetic modification | |||||||||||||||||||||||||||
Name of the tag | HA | ||||||||||||||||||||||||||
Details of tagging | C-terminal | ||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks: tagging | |||||||||||||||||||||||||||
Commercial source of tag-antibodies | |||||||||||||||||||||||||||
Type of plasmid/construct | (Linear) plasmid double cross-over | ||||||||||||||||||||||||||
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | Yes | ||||||||||||||||||||||||||
Name of PlasmoGEM construct/vector | - | ||||||||||||||||||||||||||
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No | ||||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct map | |||||||||||||||||||||||||||
Plasmid/construct sequence | |||||||||||||||||||||||||||
Restriction sites to linearize plasmid | |||||||||||||||||||||||||||
Selectable marker used to select the mutant parasite | No selectable marker | ||||||||||||||||||||||||||
Promoter of the selectable marker | No | ||||||||||||||||||||||||||
Selection (positive) procedure | No | ||||||||||||||||||||||||||
Selection (negative) procedure | No | ||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks genetic modification | The hdhfr/yfcu selectable marker cassette used to HA-tag FLP has been removed by negative selection | ||||||||||||||||||||||||||
Additional remarks selection procedure | |||||||||||||||||||||||||||
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Type and details of transgene | |||||||||||||||||||
Is the transgene Plasmodium derived | Transgene: not Plasmodium | ||||||||||||||||||
Transgene name | RFP | ||||||||||||||||||
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Details of the genetic modification | |||||||||||||||||||
Inducable system used | No | ||||||||||||||||||
Additional remarks inducable system | |||||||||||||||||||
Type of plasmid/construct | (Linear) plasmid double cross-over | ||||||||||||||||||
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No | ||||||||||||||||||
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No | ||||||||||||||||||
Plasmid/construct map | |||||||||||||||||||
Plasmid/construct sequence | |||||||||||||||||||
Restriction sites to linearize plasmid | |||||||||||||||||||
Selectable marker used to select the mutant parasite | No selectable marker | ||||||||||||||||||
Promoter of the selectable marker | No | ||||||||||||||||||
Selection (positive) procedure | No | ||||||||||||||||||
Selection (negative) procedure | No | ||||||||||||||||||
Additional remarks genetic modification | The hdhfr/yfcu selectable marker cassette used to introduce RFP has been removed by negative selection | ||||||||||||||||||
Additional remarks selection procedure | |||||||||||||||||||
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Other details transgene | |||||||||||||||||||
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Promoter | |||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_1319500 | ||||||||||||||||||
Gene Model P. falciparum ortholog | PF3D7_1455800 | ||||||||||||||||||
Gene product | LCCL domain-containing protein | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | LAP4; LCCL/lectin adhesive-like protein 4; CCp2 | ||||||||||||||||||
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3'-UTR | |||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_1359600 | ||||||||||||||||||
Gene product | transmission blocking target antigen precursor 6-cysteine protein | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | P48/45 | ||||||||||||||||||
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Insertion/Replacement locus | |||||||||||||||||||
Replacement / Insertion | Replacement locus | ||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_0306000 | ||||||||||||||||||
Gene product | 6-cysteine protein | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | 230p | ||||||||||||||||||
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Type and details of transgene | |||||||||||||||||||
Is the transgene Plasmodium derived | Transgene: not Plasmodium | ||||||||||||||||||
Transgene name | GFP | ||||||||||||||||||
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Details of the genetic modification | |||||||||||||||||||
Inducable system used | No | ||||||||||||||||||
Additional remarks inducable system | |||||||||||||||||||
Type of plasmid/construct | (Linear) plasmid double cross-over | ||||||||||||||||||
PlasmoGEM (Sanger) construct/vector used | No | ||||||||||||||||||
Modified PlasmoGEM construct/vector used | No | ||||||||||||||||||
Plasmid/construct map | |||||||||||||||||||
Plasmid/construct sequence | |||||||||||||||||||
Restriction sites to linearize plasmid | |||||||||||||||||||
Selectable marker used to select the mutant parasite | No selectable marker | ||||||||||||||||||
Promoter of the selectable marker | No | ||||||||||||||||||
Selection (positive) procedure | No | ||||||||||||||||||
Selection (negative) procedure | No | ||||||||||||||||||
Additional remarks genetic modification | The hdhfr/yfcu selectable marker cassette used to introduce GFP has been removed by negative selection | ||||||||||||||||||
Additional remarks selection procedure | |||||||||||||||||||
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Other details transgene | |||||||||||||||||||
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Promoter | |||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_0416100 | ||||||||||||||||||
Gene Model P. falciparum ortholog | PF3D7_0905300 | ||||||||||||||||||
Gene product | dynein heavy chain, putative | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | |||||||||||||||||||
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3'-UTR | |||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_1010600 | ||||||||||||||||||
Gene product | calmodulin, putative | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | cam | ||||||||||||||||||
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Insertion/Replacement locus | |||||||||||||||||||
Replacement / Insertion | Replacement locus | ||||||||||||||||||
Gene Model of Parasite | PBANKA_0306000 | ||||||||||||||||||
Gene product | 6-cysteine protein | ||||||||||||||||||
Gene product: Alternative name | 230p | ||||||||||||||||||
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